Linux下命令的一些异常情况

命令不全：在命令没有输入完 (引号或括号没有配对)，就不小心按下了Enter键，终端会提示出一个>代表命令不完整，这是可以继续输入，也可以ctrl+c终止输入，重新再来。(下面sed命令使用时，还有另外一种命令不全的问题)

ct@ehbio:~/ehbio_project$ rename 'ehbio2
>'
ct@ehbio:~/ehbio_project$ rename 'ehbio2
> ^C
ct@ehbio:~/ehbio_project$

文件名输入错误: 多一个字母、少一个字母、大小写问题

ct@ehbio:~/ehbio_project$ls
ehbio2.fa  ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio.fa  second.fa

# 重命名没有生效
ct@ehbio:~/ehbio_project$ rename 'ehbio2' 'ehbio5' ebio2.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
ehbio2.fa  ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio.fa  second.fa

# 仔细看是ehbio2.fa写成了ebio2.fa，更正后即可。
Z8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~/ehbio_project$ rename 'ehbio2' 'ehbio5' ehbio2.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio.fa  second.fa

所在目录不对: 访问的文件不存在于当前目录，而又没有提供绝对路径, 或软连接失效

ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio6.fa  ehbio.fa  second.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls ../data
ehbio2.fa  first.fa

# 当前目录没有ehbio2.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ less ehbio2.fa
ehbio2.fa: 没有那个文件或目录

# ehbio2.fa在上一层目录的data目录下
ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls ../data/ehbio2.fa
../data/ehbio2.fa

# 加上路径依然访问不了
ct@ehbio:~/ehbio_project$ less ../data/ehbio2.fa
../data/ehbio2.fa: 没有那个文件或目录

# 上面的问题是软连接失效，在之前的操作中删掉了原始的ehbio2.fa，所以快捷方式失效

# 正确的访问
ct@ehbio:~/ehbio_project$ tail -n 3 ../data/first.fa
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
CAGGACAGGAGCTA
endLinux终端常用快捷操作

• 命令或文件名自动补全：在输入命令或文件名的前几个字母后，按Tab键，系统会自动补全或提示补全
• 上下箭头：使用上下箭头可以回溯之前的命令，增加命令的重用，减少输入工作量
• !加之前输入过的命令的前几个字母，快速获取前面的命令
  
  

ct@ehbio:~/ehbio_project$ cut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4
>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
CAGGACAGGAGCTA
end
ct@ehbio:~/ehbio_project$ man cut
# 直接跳到上面运行的cut命令，再执行一次
ct@ehbio:~/ehbio_project$ !cut
cut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4
>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
CAGGACAGGAGCTA
end

• ctrl+a回到命令的行首，用于修改常命令或注释掉命令
  
  

# 写完下面的命令，突然不想运行了，又不想一个个删掉
ct@ehbio:~/ehbio_project$ cut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4

# 按ctrl+a, 回到行首，再输入`#`号，回车，命令即被注释掉。
ct@ehbio:~/ehbio_project$ #cut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4

• !! 表示上一条命令。
  
  

ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio6.fa  ehbio.fa  second.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ !!
ls
ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio6.fa  ehbio.fa  second.fa

• 替换上一个命令中的字符，再运行一遍命令，用于需要对多个文件执行同样的命令，又不想写循环的情况
  
  

# 输入一个命令
ct@ehbio:~/ehbio_project$ #cut -f 1 -d ' ' ehbio.fa | tail -n 4

# !!表示上一条命令
# :gs表示替换，把上一个命令中全部的ehbio替换为ehbio3; g: global; s: substitute
ct@ehbio:~/ehbio_project$ !!:gs/ehbio/ehbio3
#cut -f 1 -d ' ' ehbio3.fa | tail -n 4

# 替换后效果如上

# 去掉命令前的#号
ct@ehbio:~/ehbio_project$ cut -f 1 -d ' ' ehbio3.fa | tail -n 4
>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
CAGGACAGGAGCTA
end

## 替换ehbio3为ehbio4，直接运行命令
ct@ehbio:~/ehbio_project$ !!:gs/ehbio3/ehbio4
cut -f 1 -d ' ' ehbio4.fa | tail -n 4
>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
CAGGACAGGAGCTA

end