如题，KEIL使用人多，但是好像不支持文件层叠，感觉不好管理几百个文件；

工程文件多，但是要改的东西不多吧，大多数文件不用动。
把文件分类，放到几个文件夹。把要改的与不动的也分开。

这个多文件的话我觉得 GNU make 和 GCC 还是比较放心。IDE 的话考虑用 Eclipse CDT。

各有各的优势，使用习惯就好

使用keil或者IAR都可以，其实如果大部分代码不需要改动，可以打包成库文件，这样可以大大减少源代码的数量，现在又一些原厂的Demo工程已经把部分不常改动的文件都打包成库了，虽然也提供源代码，但是大部分情况下是不需要改动的，这将会大大提高项目的简洁性。

如果用到C++，IAR对C++的支持远远好于Keil。